为应对突发情况，山本五十六还设置了两项预警措施。
第一项，是派出海军重型水上飞机川崎二式大艇，对珍珠港进行远程空中侦察，确保美军航母正在港内待命，称为“K作战”。
第二项是设置潜艇防线，以便在美军航母前往中途岛时尽早向第一突击编队、第一舰队和第二舰队通报敌方的行动。
但实际上，空中侦察行动因故取消，当时海面有很浓厚的大雾天气，即使起飞了侦查机也看不到海面什么......潜艇也推迟到美军航母已经出击后方才就位。
所以从实际上讲，这两个预警计划都是形同虚设，毫无卵用。
因为其构想并没有实现有利的军事价值。也导致了中途岛的日军舰群最终中美军舰队埋伏的惨痛后果。
所以战争讲究的不仅仅是军备和战力，还有天时地利人和的因素。
在后来我们去分析一下中途岛战役的作战计划，其制定过程就充满妥协和匆忙。
可笑的是整个计划，系为赶在对马海峡海战纪念日，日本海军节当日派出舰队。
但在日军当时看来，该计划本身颇为周详，组织严密，时机掌握得也很好。
相对于日军计划投入决战的四艘舰队航母，二艘轻型航母，十一艘战列舰，十六艘巡洋舰和四十六艘驱逐舰，美国海军只拿得出三艘航母、八艘巡洋舰和十五艘驱逐舰。
可见得系兵力上的力量悬殊。交战双方只在大型航母数量，可供调动的飞机数量，以及潜艇数量上才较为接近。
就理论数据这样看上去，如果不出意外的话，山本将拥有一面倒的巨大优势。
但是事实上，现实对山本五十六来说非常不幸，确实出了很大的意外。
这种意外就是人算不如天算。
对于指挥官来说最可怕的事莫过于敌人对自己的作战计划了如指掌。
而美国海军密码破译部门恰好做到了这一点。后者早已破译了日本海军D号密码（美军称为JN-25）。
结果，美国太平洋舰队司令切斯特?威廉?尼米兹海军上将，成功地破解了山本设下的两项预警措施，并将美方仅有的部队配置在最适合对日军航母实施伏击的位置上。
这等同于所谓的优势荡然无存，而且一个陷阱相反系变成了套牢山本计划的绞索......
据尼米兹上将计算，他的三艘大型航母再加上中途岛机场，勉强足够与南云指挥的第一突击编队抗衡。
在五月份接报有日军水上飞机进行骚扰性空袭之后，尼米兹立刻派遣一艘扫雷艇，前去守卫日军计划给参加K作战的水上飞机加油的地点，导致日军的侦察行动取消，山本无法确定美军航母是否一直在珍珠港里待命。
尼米兹也提早派遣美军航母离开珍珠港，赶在山本的潜艇警戒线成型以前进入伏击地点，这一系列的情报泄露，都使山本五十六的所有预警措施归于无效。
日军这时，按时的对阿留申群岛展开了象征性的攻击，但美军航母专心设伏，实际上没有被引诱北上。
山本本以为美军航母要在数日之后才能赶来救援中途岛，没想到战役开始当天——1942年6月4日——美军便抓住日军航母最脆弱的时机发动攻击，一举击沉了第一突击编队的全部四艘舰队航母。
之后的瓜岛战役失败后，山本在参谋长宇垣缠的激励下，决定前往南太平洋前线视察以便鼓舞士气。
中国国民党重庆军技部，池步洲截获并且破译了包含山本行程详细信息的电文，包括到达时间、离埠时间和相关地点，以及山本即将搭乘的飞机型号和护航阵容。
一个美军袭击山本座机的计划开始筹划中。
此时山本五十六开始准确地判断，他此刻已没有胜算，遂宣布放弃占领中途岛的任务并全军撤退。
这次失败使山本持续六个月的成功历程告一段落，日军的扩张也到此为止。
山本的中途岛作战此后广受指责。批评意见认为山本违反了军事作战“集中兵力”的基本原则，而且作战计划过于复杂。但也有意见指出盟军也实施过复杂程度不相上下的作战而且获得成功，并将失败的原因归咎于美军破译日军密码，在事先已对山本的计划洞若观火。但若山本没有驳回南云提出的在空袭前先进行侦察的的请求，便可以抵消美军破译密码并埋伏航母所获得的优势。
(本章完)
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